Syndoxis se base sur une architecture distribuée lui permettant de créer et gérer des groupes de travail entre des médecins localisés dans différents endroits, villes, pays et meme continents.

Syndoxis contient également des modules de centralisation des bases de données de différents médecins d'une association. Cela est bénéficiaire dans plusieurs cas, la génération de statistiques nationales portant sur des maladies rares ou autres est l'un des avantages.